في إطار انفتاحها على محيطها الإقليمي وتعزيز حضورها في الفضاء الأكاديمي المغاربي، أبرمت جامعة جندوبة اتفاقية توأمة مع جامعة صبراتة الليبية .
 وتهدف هذه الاتفاقية إلى إرساء شراكة استراتيجية بين الجامعتين، تقوم على تطوير التعاون في مجالات التعليم العالي والبحث العلمي، بما يسهم في تبادل الخبرات وتعزيز جودة التكوين والانفتاح على التجارب الأكاديمية المشتركة.
وتشمل مجالات التعاون تنظيم برامج أكاديمية مشتركة، وتبادل طلبة الإجازة والماجستير والدكتوراه، والإشراف المشترك على أطروحات الدكتوراه إلى جانب تبادل أعضاء هيئة التدريس والباحثين وإنجاز مشاريع بحثية مشتركة، وتنظيم المؤتمرات والندوات العلمية وإصدار منشورات أكاديمية مشتركة فضلاً عن تبادل الوثائق والمنشورات العلمية.
وتؤكد هذه التوأمة مرة أخرى التزام جامعة جندوبة بمواصلة مسار الانفتاح على محيطها الخارجي عبر إرساء شراكات استراتيجية مع مؤسسات التعليم العالي داخل تونس وخارجها بما يعزز إشعاعها الأكاديمي والعلمي ويدعم مكانتها كجامعة رائدة تؤمن بأن التعاون الدولي ركيزة أساسية لتطوير التكوين والبحث والابتكار، وخدمة أهداف التنمية المستدامة وهي التي وقعت خلال السنوات الأخيرة اتفاقيات مع جامعات جزائرية و جامعات افريقية .